Алгоритмы в биоинформатике

Курс "Алгоритмы в биоинформатике" будет проходить осенью 2013 года в ведущих вузах России.

Кураторы курса:

Участники курса:

Обучение на курсе организовано по модели blended learning. В курсе будут использованы современные технологии онлайн-обучения (короткие видео лекции, автоматизированная проверка домашних заданий) совместно с традиционными методами, такими как проектная работа в классе и экзамены.

Предварительная программа:

  1. Where in a Genome Does DNA Replication Begin? / Algorithmic Warm-up
  2. How Do We Sequence Antibiotics? / Brute Force Algorithms
  3. What DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks inside the Cells? Greedy and Randomized Algorithms
  4. How Do We Assemble Genomes? / Graph Algorithms
  5. Are there Fragile Regions in the Human Genome? / Combinatorial Algorithms
  6. How Do We Compare Biological Sequences? / Dynamic Programming Algorithms
  7. How Do We Locate Disease-Causing Mutations? / Combinatorial Pattern Matching
  8. How Have Humans Populated the Earth? / Clustering and Tree Reconstruction

Детали:

  • Павел Певзнер и Николай Вяххи прочтут вводные лекции во всех вузах-участниках в сентябре 2013.
  • Длительность курса — 16 недель.
  • Курс базируется на материалах онлайн курса по биоинформатике.